生殖器上长小水泡可能是疱疹病毒感染、接触性皮炎、龟头包皮炎、阴茎硬结症、药物过敏反应等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗.建议患者及时就医，以便获得准确诊断和适当治疗。

1.疱疹病毒感染

疱疹病毒感染是由特定病毒如单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒等引起的一种传染性疾病。这些病毒通过复制和扩散导致皮肤和黏膜出现水泡。抗病毒药物是主要治疗方法，例如口服伐昔洛韦片或涂抹阿昔洛韦乳膏可减轻病情。

2.接触性皮炎

接触性皮炎由皮肤直接接触到刺激物或过敏原而引起炎症反应，导致局部红斑、水肿和水泡形成。患者可以遵医嘱使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药膏进行治疗。

3.龟头包皮炎

龟头包皮炎通常由细菌感染引起，当病原体侵入龟头和包皮组织时，会引起局部免疫应答和炎症反应，可能导致局部出现小水泡。患者可以在医生指导下使用克霉唑溶液、曲安奈德益康唑乳膏等药物缓解不适症状。

4.阴茎硬结症

阴茎硬结症是一种以纤维化组织形成的阴茎海绵体白膜上的斑块为特征的疾病，由于阴茎勃起时血液循环受阻，可能会导致局部缺血缺氧，从而形成小水泡。本病一般不需特殊处理，严重者可通过手术切除硬结。

5.药物过敏反应

药物过敏反应是指机体对某些药物产生异常免疫反应，引起组织损伤和炎症反应，导致皮肤出现红斑、水泡等症状。患者需要及时停用致敏药物，并在医生指导下服用氯雷他定片、盐酸西替利嗪胶囊等抗组胺药物进行抗过敏治疗。

建议定期进行性健康体检，包括血液检测以及尿液分析，以便早期发现并处理相关问题。同时注意个人卫生，保持生殖器干燥清洁，避免使用刺激性强的洗剂。